Нижегородская епархия существует с 1672 года, учреждена в составе Нижнего Новгорода, Алатыря, Курмыша и Ядрина с определенными селениями. Правящему архиерею епархии был дан титул «Митрополит Нижегородский и Алатырский».
С 1719 года во главе епархии стоял епископ, а с 1991 года до 2001 года — снова митрополит.
В конце XVIII столетия Нижегородская епархия была введена в границы Нижегородской губернии, и епархиальный архиерей с 1799 года стал именоваться «Нижегородский и Арзамасский».
В 1866 году учреждено Балахнинское викариатство.
На 1912 год епархия насчитывала православного населения 1 604 269 человек, церквей 1131, часовен и молитвенных домов 211, монастырей 28 (7 мужских и 21 женский), церковно-приходских попечительств 119, библиотек при церквах 106, при благочиннических округах 30, церковных 571, в них учащихся 27 351 человек, Духовную семинарию, мужское и женское Духовные училища, 65 протоиереев, 1023 священника, 412 дьяконов, 1002 псаломщика.
За 330 лет Нижегородской кафедрой управляли 48 архиереев. Первым Нижегородским архиереем стал постриженник Макарьев-Желтоводского Троицкого монастыря, настоятель Печерского Вознесенского монастыря Нижнего Новгорода архимандрит Филарет (годы епископства 1672-1682).
Определением Юбилейного Архиерейского собора 2000 года к лику святых был причислен сонм Новомучеников и Исповедников Российских, среди которых — священномученик Лаврентий, епископ Балахнинский и другие подвижники земли Нижегородской.
Нижегородская митрополия образована решением Священного Синода РПЦ от 15 марта 2012 года (журнал № 7). Из состава епархии выделены Выксунская, Городецкая и Лысковская епархии. Нижегородская епархия включена в состав Нижегородской митрополии.